肾为先天之本，在五行属水，为阴中之阴；主要生理功能包括肾主藏精（主生长发育与生殖、为脏腑之本、主生髓化血、主抵御外邪），肾主水（调节并参与津液代谢相关脏腑功能、调节尿液的生成与排泄），肾主纳气；主要生理特性包括肾主蛰藏、肾睡宜升、肾恶燥；生理联系包括肾藏志，在志为恐，在体合骨，其华在发，开窍于耳和二阴，在液为唾，与冬气相通应，与膀胱互为表里。对于肾主骨的理论依据，《皇帝内经》对其有丰富的描述
《素问·五藏生成论》曰: “肾之合骨也”。
《素问·六节藏象论》曰: “肾者,……其充在骨”。
《素问·宣明五气论》曰: “五藏所主: 心主脉,肺主皮,肝主筋,脾主肉,肾主骨,是谓五主。”
《素 问·逆调论》 曰：“肾不生，则髓不能满”
肾藏精，精生髓，精髓充养骨骼、脊髓等，骨骼的发育是形体发育状态的标志之一，由肾精充养，由肾气推动与调控。
肾藏精，精生髓，髓居骨中，骨骼赖之以生长发育。
故肾精的充盈与否能直接影响骨的成长、壮健与再生，反之，若肾精不足则骨骼失养，易出现骨软无力，老年人骨质疏松等。
《素问·上古天真论》 中以“女子七岁，肾气盛，齿更发长……三七，肾气平均，故真牙生而长极；四七，筋骨坚，发长极，身体盛壮……七七，任脉虚，太冲脉衰少，天癸竭，地道不通，故形坏而无子也。”及“丈夫八岁，肾气实，发长齿更……二八，肾气盛……三八，肾气平均，筋骨劲强，真牙生而长极；四 八，筋骨隆盛，肌肉满壮；五八，肾气衰，发堕齿槁……七八，肾脏衰，形体皆极；八八，则齿发去。”
指明肾精充盛状况与骨骼生长发育之间的关系会随年龄增长呈现曲线改变，且存在明显的性别差异。
在骨伤科疾病中所见的“伤骨”病症，包括骨折、脱位、以及直接暴力、间接暴力、累积暴力或年老体衰所引起的。《圣济总录》则以“补肝肾以壮骨”提出补肾当为“肾主骨” 理论的临床治疗方法。其实骨病补肾乃是中医治病求本的体现，而不是单纯的骨关节痛就止痛，或者某处骨折仅仅接上是不行的，还要用一些补肝肾，促进骨折生长的药物，来促进骨折的愈合，防止骨折迟缓愈合或骨折不愈合的发生。总体而言，“肾主骨”作为中医藏象理论的一部分，强调“肾”与“骨”的生理功能存在紧密的联系，且骨伤科疾病均可以从肾主骨的理论来进行论治。
